Отбор и исследование проб воды по санитарно-химическим и микробиологическим показателям проводился на озёрах Белое, Новое, Рассошное, Кудьмозеро, Кородское, на реках Солза, Ширшима, Кудьма, Северная Двина, на Белом море, на четырёх рефулёрных озёрах в черте города. Также проводился отбор и исследование песка пляжной зоны о. Ягры.
На протяжении ряда лет наблюдений некоторые водоёмы обладают стабильно удовлетворительным качеством воды, другие же характеризуются неустойчивым качеством даже в пределах одного летнего периода. Чистым водоёмом является река Солза, которая является источником централизованного водоснабжения Северодвинска. Превышений по содержанию химических веществ, бактериологическим показателям в речной воде не установлено.
По результатам исследований других водоёмов. Выяснилось, что несколько из них не соответствуют нормам по ряду санитарно-химических и микробиологических показателей. Это - река Кудьма («грязный» створ в пределах города), залив Параниха, река Северная Двина, рефулёрные озёра (Кислое, Театральное, на ул. Железнодорожной, на пр. Ленина).
Удовлетворительные оценки получили река Ширшема, Белое море, озёра: Белое, Кудемское, Кородское, Рассошное. Пробы песка пляжной зоны острова Ягры соответствуют требованиям по санитарно-химическим и микробиологическим показателям.
Роспотребнадзор рекомендует при купании в любом водоёме учитывать погодные условия, не употреблять алкоголь, не заглатывать воду, а по приходу домой принять душ.